西元2000年，國立嘉義技術學院與國立嘉義師範學院合併，設立「國立嘉義大學」，為嘉義唯一國立綜合大學。
目前共有四個校區：蘭潭校區（農學院、理工學院及生命科學院）、林森校區（產學營運及推廣處）、新民校區（管理學院及獸醫學院）、民雄校區（人文藝術學院及師範學院），另有社口實習林場。下設七個學院，三十九個學系、四個碩士學位學程、三十八個碩士班、十五個碩士在職專班、六個博士班、一個博士學位學程。
| 學院 | 隸屬學系 |
|---|---|
| 師範學院 | 教育學系 輔導與諮商學系 體育與健康休閒學系 幼兒教育學系 教育行政與政策發展研究所 數理教育研究所 |
| 人文藝術學院 | 中國文學系 應用歷史學系 |
| 管理學院 | 管理學院EMBA甲－一般管理組 管理學院EMBA乙－創意產業與觀光休閒管理組 |
| 農學院 | 農學院農學碩士 |
| 理工學院 | 生物機電工程學系 土木與水資源工程學系 |
| 生命科學院 | 食品科學系 生化科技學系 |
